Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
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