Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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PTPN13Q12923 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPN13Q12923 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPN13Q12923 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPN13Q12923 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPN13Q12923 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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PTPN13Q12923 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
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PTPN13Q12923 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTPN13Q12923 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPN13Q12923 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPN13Q12923 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPN13Q12923 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPN13Q12923 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPN13Q12923 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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PTPN13Q12923 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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PTPN13Q12923 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPN13Q12923 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPN13Q12923 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPN13Q12923 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPN13Q12923 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTPN13Q12923 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPN13Q12923 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPN13Q12923 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPN13Q12923 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PTPN13Q12923 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPN13Q12923 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PTPN13Q12923 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPN13Q12923 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPN13Q12923 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPN13Q12923 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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