Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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GTF3C1Q12789 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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GTF3C1Q12789 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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GTF3C1Q12789 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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GTF3C1Q12789 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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GTF3C1Q12789 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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GTF3C1Q12789 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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GTF3C1Q12789 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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GTF3C1Q12789 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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GTF3C1Q12789 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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