Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms