Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL16A1Q07092 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms