Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU5F1Q01860 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms