Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RELBQ01201 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RELBQ01201 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RELBQ01201 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RELBQ01201 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RELBQ01201 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms