Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3S2P59780 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S2P59780 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S2P59780 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S2P59780 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S2P59780 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S2P59780 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S2P59780 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S2P59780 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S2P59780 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S2P59780 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S2P59780 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S2P59780 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S2P59780 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S2P59780 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S2P59780 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S2P59780 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S2P59780 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S2P59780 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S2P59780 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S2P59780 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S2P59780 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AP3S2P59780 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S2P59780 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S2P59780 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S2P59780 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S2P59780 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms