Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAG2P55895 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAG2P55895 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAG2P55895 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAG2P55895 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAG2P55895 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAG2P55895 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAG2P55895 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAG2P55895 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAG2P55895 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAG2P55895 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAG2P55895 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAG2P55895 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAG2P55895 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAG2P55895 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAG2P55895 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAG2P55895 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAG2P55895 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAG2P55895 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAG2P55895 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAG2P55895 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAG2P55895 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAG2P55895 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms