Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms