Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA2P54646 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms