Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTPAP49638 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TTPAP49638 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
TTPAP49638 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTPAP49638 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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