Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM4P49221 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM4P49221 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM4P49221 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM4P49221 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM4P49221 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM4P49221 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM4P49221 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM4P49221 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM4P49221 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM4P49221 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms