Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms