Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK1P39086 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms