Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETFBP38117 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETFBP38117 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETFBP38117 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETFBP38117 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETFBP38117 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms