Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms