Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBRP36941 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBRP36941 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBRP36941 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBRP36941 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBRP36941 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBRP36941 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBRP36941 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBRP36941 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBRP36941 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBRP36941 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBRP36941 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBRP36941 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBRP36941 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBRP36941 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBRP36941 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBRP36941 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBRP36941 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBRP36941 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBRP36941 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LTBRP36941 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms