Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA3P35244 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA3P35244 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA3P35244 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA3P35244 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA3P35244 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA3P35244 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA3P35244 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA3P35244 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA3P35244 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA3P35244 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA3P35244 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA3P35244 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA3P35244 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA3P35244 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA3P35244 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA3P35244 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA3P35244 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA3P35244 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA3P35244 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA3P35244 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA3P35244 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA3P35244 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA3P35244 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA3P35244 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA3P35244 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA3P35244 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms