Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGER1P34995 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGER1P34995 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGER1P34995 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGER1P34995 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGER1P34995 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGER1P34995 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTGER1P34995 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTGER1P34995 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTGER1P34995 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTGER1P34995 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTGER1P34995 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTGER1P34995 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGER1P34995 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms