Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTX2P32243 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTX2P32243 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms