Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms