Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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PSMB5P28074 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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PSMB5P28074 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PSMB5P28074 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PSMB5P28074 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PSMB5P28074 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PSMB5P28074 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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