Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms