Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms