Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPREP23469 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPREP23469 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPREP23469 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPREP23469 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPREP23469 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPREP23469 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPREP23469 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPREP23469 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPREP23469 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPREP23469 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPREP23469 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPREP23469 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPREP23469 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPREP23469 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPREP23469 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPREP23469 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPREP23469 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPREP23469 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPREP23469 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPREP23469 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPREP23469 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPREP23469 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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PTPREP23469 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPREP23469 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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