Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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