Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM27P14373 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms