Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRG2P13727 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRG2P13727 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRG2P13727 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRG2P13727 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRG2P13727 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRG2P13727 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRG2P13727 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRG2P13727 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRG2P13727 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRG2P13727 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRG2P13727 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRG2P13727 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRG2P13727 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRG2P13727 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRG2P13727 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRG2P13727 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRG2P13727 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRG2P13727 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRG2P13727 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PRG2P13727 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRG2P13727 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRG2P13727 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRG2P13727 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRG2P13727 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms