Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODC1P11926 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODC1P11926 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODC1P11926 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODC1P11926 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODC1P11926 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODC1P11926 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODC1P11926 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODC1P11926 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODC1P11926 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODC1P11926 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODC1P11926 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODC1P11926 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODC1P11926 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODC1P11926 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ODC1P11926 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODC1P11926 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODC1P11926 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODC1P11926 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODC1P11926 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODC1P11926 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODC1P11926 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ODC1P11926 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODC1P11926 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODC1P11926 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODC1P11926 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODC1P11926 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODC1P11926 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODC1P11926 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODC1P11926 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODC1P11926 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODC1P11926 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODC1P11926 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODC1P11926 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODC1P11926 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODC1P11926 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODC1P11926 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODC1P11926 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODC1P11926 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODC1P11926 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODC1P11926 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODC1P11926 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODC1P11926 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ODC1P11926 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ODC1P11926 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms