Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHGAP10645 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHGAP10645 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHGAP10645 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHGAP10645 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHGAP10645 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHGAP10645 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHGAP10645 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHGAP10645 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHGAP10645 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHGAP10645 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHGAP10645 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHGAP10645 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHGAP10645 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHGAP10645 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHGAP10645 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHGAP10645 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHGAP10645 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHGAP10645 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHGAP10645 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHGAP10645 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHGAP10645 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHGAP10645 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHGAP10645 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHGAP10645 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHGAP10645 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHGAP10645 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHGAP10645 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CHGAP10645 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHGAP10645 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHGAP10645 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CHGAP10645 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHGAP10645 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHGAP10645 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHGAP10645 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHGAP10645 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHGAP10645 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHGAP10645 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHGAP10645 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHGAP10645 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHGAP10645 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHGAP10645 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHGAP10645 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHGAP10645 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHGAP10645 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHGAP10645 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHGAP10645 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHGAP10645 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHGAP10645 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHGAP10645 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHGAP10645 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHGAP10645 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHGAP10645 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHGAP10645 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHGAP10645 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHGAP10645 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHGAP10645 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHGAP10645 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHGAP10645 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHGAP10645 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHGAP10645 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHGAP10645 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHGAP10645 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHGAP10645 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHGAP10645 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHGAP10645 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHGAP10645 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHGAP10645 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHGAP10645 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHGAP10645 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHGAP10645 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHGAP10645 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHGAP10645 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHGAP10645 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHGAP10645 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHGAP10645 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHGAP10645 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHGAP10645 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHGAP10645 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHGAP10645 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHGAP10645 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms