Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms