Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
U2AF1L5P0DN76 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms