Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXB7P09629 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms