Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLK3P07288 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLK3P07288 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLK3P07288 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLK3P07288 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLK3P07288 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLK3P07288 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLK3P07288 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLK3P07288 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLK3P07288 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLK3P07288 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLK3P07288 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLK3P07288 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLK3P07288 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLK3P07288 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLK3P07288 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
KLK3P07288 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLK3P07288 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLK3P07288 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLK3P07288 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLK3P07288 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLK3P07288 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLK3P07288 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLK3P07288 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLK3P07288 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLK3P07288 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLK3P07288 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLK3P07288 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLK3P07288 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLK3P07288 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLK3P07288 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLK3P07288 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLK3P07288 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLK3P07288 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLK3P07288 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLK3P07288 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLK3P07288 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLK3P07288 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms