Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFLP07196 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFLP07196 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFLP07196 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFLP07196 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFLP07196 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFLP07196 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFLP07196 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFLP07196 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFLP07196 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFLP07196 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFLP07196 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFLP07196 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFLP07196 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFLP07196 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFLP07196 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFLP07196 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFLP07196 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFLP07196 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
NEFLP07196 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
NEFLP07196 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NEFLP07196 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFLP07196 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms