Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK1P06493 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK1P06493 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK1P06493 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK1P06493 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK1P06493 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK1P06493 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK1P06493 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK1P06493 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK1P06493 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK1P06493 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK1P06493 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK1P06493 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK1P06493 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK1P06493 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK1P06493 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK1P06493 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK1P06493 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK1P06493 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK1P06493 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK1P06493 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK1P06493 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK1P06493 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK1P06493 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK1P06493 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms