Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-11P04433 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms