Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN9O95484 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CLDN9O95484 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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