Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX4O95219 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms