Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DENRO43583 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DENRO43583 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DENRO43583 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DENRO43583 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DENRO43583 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DENRO43583 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DENRO43583 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DENRO43583 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DENRO43583 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DENRO43583 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DENRO43583 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms