Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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