Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms