Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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