Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms