Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HPS5Q9UPZ3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms