Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3Q9UPQ7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms