Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms