Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRQQ9UMZ3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms