Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MLH3Q9UHC1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MLH3Q9UHC1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms